本发明提供了一种富水软土地层的地连墙接缝缺陷处理方法，包括如下步骤：地连墙接缝缺陷统计、施工准备、点位确定、机具就位、钻孔、预制双液浆、注浆和监控量测八个步骤。本发明可以根据地连墙所在不同地层进行合理的接缝补强和堵水方案，并提出具体有效的注浆参数与判别准则，使得地连墙缺陷治理更有针对性，同时整套富水软土地层的地连墙接缝缺陷处理方法施工机械设备简单，工艺操作简易，无场地及施工条件的限制，施工成本低便于推广。本方法在杭州地铁6号线二期工程火车东站38m深超深基坑、1.5m厚58‑60m深的地连墙成功的应用，即将超深的地连墙渗漏率降低至接近为0，保障了目前为止杭州地铁最深的超深基坑群顺利见底，具有较高的应用价值。