本发明公开了一种基于MEMS串联开关的高功率自动保护电路，包括功分器、整流器、电压比较器、MEMS串联开关，当功分器功率输入口输入功率小于等于设定的安全阈值，且电压比较器输入电压小于等于基准电压时，电压比较器输入到MEMS串联开关的电压为低电平，MEMS串联开关处于闭合状态；当功分器功率输入口输入功率大于设定的安全阈值，且电压比较器输入电压大于基准电压时，电压比较器输入到MEMS串联开关的电压为高电平，MEMS串联开关断开。本发明能够在高功率输入条件下自适应地断开信号通路，即便输入信号功率大小存在波动的情况下，也能自适应地选择开关的开启或断开状态。