本发明公开了一种对虾抗病性状的选育方法，所述方法包括：构建对虾家系的测试群体和保种群体；对测试群体进行病原感染，获取每个死亡个体的个体存活时间；基于测试群体构建参考群体；获得参考群体的SNP分型数据；估计参考群体的个体基因组育种值；获得保种群体的SNP分型数据；基于参考群体的所述个体存活时间、参考群体共有SNP位点的分型数据和保种群体共有SNP位点的分型数据，估计保种群体的个体基因组育种值；根据保种群体的个体基因组育种值选择保种个体进行留种和配种。应用本发明，可以提高对虾抗病性状的选择准确性。