本发明提供一种集装箱码头ART和有人集卡的智能协同组织方法，包括：设置岸桥两轨之间作业区车道区、堆场横向作业车道区、堆场纵向车道区；岸桥两轨之间作业区车道区、堆场作业车道区不同作业区之间车道用围栏分隔；堆场区有人与ART车道横向车道间隔布置、纵向相邻布置；运输过程中，横纵车道交汇处采用基于多优先级规则的全局优化策略进行智能交通管控，利用集卡协同组织方法，提高集卡通行效率，保障作业能力。本发明优化了自动化集装箱码头有人集卡与ART的协作运输流程，提升了集装箱码头整体的管理水平与生产作业效率。