本发明公开了一种利用连续流微通道反应器氧化合成萘普生的方法，属于医药中间体技术领域。将2‑(6‑甲氧基‑2‑萘基)丙醛与溶剂形成的均相溶液再与氧化剂分别经计量泵打入微通道反应器中，在微通道中混合接触进行氧化反应，得到(±)‑2‑(6‑甲氧基‑2‑萘基)丙酸，即为萘普生。本发明所述方法解决了现有反应时间长，反应条件要求高，工艺安全系数低，成本高等问题，并具有操作简单、工艺安全性高、反应时间短、转化率和选择性好、产物纯度高、可连续化生产、可快速工业化放大等优点，反应结束后物料可以直接进入后处理操作，后处理简单，产物收率达到95％以上，纯度99％以上。