本发明公开了一种横穿上部建筑桩基下方的地下通道的上下分挖式施工方法，建筑工作井；全断面挖至距离上部建筑的第一排桩基的距离D的位置而形成第一段毛坯通道，在第一段毛坯通道内浇筑第一段毛坯通道部通道护壁框架，在保留第一排桩基下部的土体的前提下继续开挖至距离上部建筑的第二排桩基的距离D的位置而形成第二段毛坯通道和第一排桩基部毛坯通道上半部，浇筑桩基托换结构的上半部分和第二段毛坯通道部通道护壁框架，截去第一排桩基和挖走保留在第一排桩基下部的土体，浇筑桩基托换结构的下半部分。本发明用于上部建筑的桩基的下端部位于新建地下通道内时的地下通道的施工。