本发明公开了一种可提供细胞内参信号的金刺纳米探针，由海胆状结构的拉曼增强金刺纳米颗粒内核和复合在拉曼增强金刺纳米颗粒表面的分子信标外壳组成。本发明还公开了上述金刺纳米探针的制备方法，包括以下步骤：将拉曼增强金刺纳米颗粒溶液和分子信标溶液混合，振荡4h，加入十二烷基硫酸钠溶液和磷酸盐缓冲液，孵育10小时以上，加入NaCl溶液，连续搅拌4小时以上，离心分离1min，然后将甲氧基聚乙二醇巯基添加到悬浮液中，用超纯水重悬，即得到金刺纳米探针。本发明提供的金刺纳米探针能够提供内参拉曼信号，在检测中，能够去除检测中的非特异性干扰，提高检测的精度，通过对比内参拉曼信号实现对靶标核酸相对表达量的检测。