本发明的一种适用5G差动保护的数据传输和保护系统、方法及存储设备，差动保护硬件单元包括差动保护控制模块，完成所在节点电压电流电气信息采集、逻辑运算和断路器跳合闸控制；外部精确授时模块，基于北斗授时、GPS授时、5G授时或者多模式混合应用这些外部精确授时系统完成差动保护各端节点的授时；5G通讯模块，基于5G通讯网络完成线路各端的差动保护装置模块间数据通讯。本发明能够在较低采样数据传输流量的情况下，实现满足应用需要的中压配电网5G差动保护性能，在正常运行状态下不发送采样点数据，只是每一周波或每数周波发送一次相量数据每次发送两遍，在故障状态下增加发送采样点数据，差动保护产生的无线流量大大降低。