本发明公开了一种混合储能系统功率分配优化方法及终端，将混合储能系统中能量型储能的充放电功率和功率型储能的充放电功率用来补偿微电网系统中的不平衡功率；采取经验模态分解方法分解不平衡功率信号，得到分解后的不平衡功率信号，将分解后的不平衡功率信号中的高频分量作为功率型储能的初次参考功率指令，将分解后的不平衡功率信号中的低频分量作为能量型储能初次参考功率指令，完成初次功率分配；通过模糊控制器对混合储能系统中的功率型储能与能量型储能的功率分配进行二次优化，调整各自对应初次参考功率，得到调节后的最终参考功率。本发明通过经验模态分解方法和模糊控制器来实现混合储能功率的优化分配，使得功率分配更加精确可靠。