本发明公开了一种预防仔猪腹泻的饲料添加剂及其制备方法和应用，该添加剂包括如下重量份原料：枯草芽孢杆菌微胶囊8‑12份、解淀粉芽孢杆菌微胶囊8‑12份、黄芪多糖10‑15份、抗菌肽1号5‑8份、抗菌肽2号5‑8份、玉米粉45‑64份。本发明通过枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌及其产物抗菌肽与植物多糖联合协同抑制病毒并提高仔猪机体免疫力，将活菌包裹在微胶囊内，提高了存活率，能有效防治仔猪腹泻，减少抗生素使用量的，同时本发明的制备方法简单高效，生物利用率高，可以较好实现防治仔猪腹泻的效果。