本发明公开了一种用于高浊度废水在线检测的水样预处理系统，包括高效凝聚剂储罐、样水澄清器、流通池、检测仪表表头及自动控制系统；废水系统取样点与样水澄清器相连通，高效凝聚剂储罐的出口与样水澄清器相连通，样水澄清器中部的澄清水样出口与流通池相连通，样水澄清器内设置有磁力搅拌器，样水澄清器的底部排污口与全厂废水处理系统相连通；流通池内安装有检测仪表电极，检测仪表电极通过电缆与检测仪表表头相连接；自动控制系统与磁力搅拌器及检测仪表表头相连接，该系统能够解决高浊度废水在线检测过程中由于悬浮物、固体颗粒造成的问题，提高在线检测仪表的使用寿命、测量精确性及稳定性。