本发明属于生物工程技术领域，涉及工业微生物的育种，特别涉及一种生产碱性蛋白酶的底盘菌株及其构建方法与用途。本发明提供了一种解淀粉芽孢杆菌基因工程菌株，该基因工程菌株不表达解淀粉芽孢杆菌基因组上的六种胞外蛋白酶基因aprE，bpr，vpr，mpr，nprE，epr，胞外多糖基因簇eps，聚谷氨酸基因簇pgs和核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示的噬菌体相关基因，优选的还异源过表达碱性蛋白酶基因aprE。本发明从实验和生产中的实际情况出发，分析影响发酵性能的不良因素，通过对基因工程宿主的改造和基因精简，最终获得了一种能够高产碱性蛋白酶的底盘菌株，并且为构建蛋白酶高产底盘菌株提供了新的思路。