本发明提供的一种风电机组变频器温度数据清洗方法及系统，包括以下步骤：步骤1，将获取得到的风电机组变频器的实际运行过程中的温度原始监测数据进行预处理，得到矩阵A；步骤2，对步骤1中获取得到的矩阵A中的温度超限点数据进行清洗，得到矩阵A’；步骤3，对步骤2中获取得到的矩阵A’中的大范围温度离群点数据进行清洗，得到矩阵A”’；步骤4，对步骤3中获取得到的矩阵A”’中的剩余温度离群点数据及堆积温度点数据进行清洗，得到正确的温度监测数据；本发明所提数据清洗方法可实现上述三类异常数据的清洗，有效数据删除率低，且无需根据历史数据进行预训练，具有较强的通用性。