本发明公开的一种烟草病害的识别与防治方法、系统及存储介质，涉及烟草病虫害防治领域。其中，烟草病毒识别与防治方法包括以下步骤：获取烟草植株的高光谱图像信息，将光谱数据信息与图像数据信息进行预处理；提取平均光谱曲线及病斑图像特征，根据所述平均光谱曲线及病斑图像特征建立烟草病害识别模型，通过所述烟草病害识别模型中的光谱识别模块及图像识别模块生成识别结果；获取光谱识别模块及图像识别模块的识别结果，并根据权重信息进行组合生成烟草病害识别结果，并根据所述病害识别结果生成病害等级；根据所述病害识别结果进行大数据处理生成病害防治方法，将所述病害识别结果、病害等级及病害防治方法按照预设方式进行显示。