本发明提供一种基于红外测温和图像识别的活畜健康检测方法、系统、设备及介质，通过划定检测区域，在检测区域内架设相机和红外温感测试仪；收集活畜健康与患病皮毛图像，标注得到毛发数据集，训练毛发数据集，得到毛发健康状况检测模型；收集牛头部正常抬起和异常低垂的图像，标注得到头部低垂数据集，训练头部低垂数据集，得到头部低垂状况检测模型；调用毛发健康状况检测模型和头部低垂状况检测模型来实时检测当前检测区域内活畜的位置坐标、毛发健康状况以及头部低垂状况；利用红外温感测试仪检测活畜位置坐标区域内的温度，再与毛发健康状况和头部低垂状况进行结合，综合判定活畜的健康状态。本发明可以高效、稳定地实时检测活畜的健康程度。