本发明公开了一种直流配电网接地故障选线方法及系统，利用母线电压不平衡判据启动MMC附加控制，注入探测信号；延时Δt采集各条馈线首端的正极电流和负极电流；对各条馈线首端的正极电流和负极电流进行滤波，设置中心频率fmp为探测信号的特征频率，得到滤波后各条馈线首端的正负极电流；对滤波后各条馈线首端的正负极电流求取各馈线零模电流并进行归一化处理，求和得到参考电流；利用归一化处理后的馈线零模电流逐个与参考电流求取波形相关性，依据皮尔森相关性系数进行故障判别确定故障线和健全线，完成直流配电网接地故障选线；本发明方法有效增强了故障特征，避免安装附加装置，具有灵敏度高、无需双端通信的特点。