本发明公开了一种混合多馈入直流系统及其无功协调控制方法和控制器，控制方法包括：步骤S1：获取公共母线交流电压UPCC，比较当前交流电压UPCC、最大运行电压Umax和最小运行电压Umin：当UPCC＞Umax时，跳转至步骤S2；当UPCC＜Umin时，跳转至步骤S3；当Umin≤UPCC≤Umax时，跳转至步骤S4；步骤S2：将柔性直流输电换流站的正序内环解耦控制的正序电流q分量的参考值设置为外环定交流电压控制的无功电流输出量，判断是否满足UPCC＜Urate，若是，则跳转至步骤S4，否则，重复步骤S2；步骤S3：将参考值设置为调相机馈入公共母线的正序电流q分量判断是否满足UPCC＞Urate，若是，跳转至步骤S4，否则，重复步骤S3；步骤S4：将参考值设置为0。通过上述方法，可以加快无功响应速度。