本发明适用于健康食品技术领域，提供一种无硫无蔗糖益生元果干及其制备方法，包含的组成以及各组分质量份如下：水果果肉原料200‑300份；护色液80‑150份；填充液80‑150份；益生元10‑50份；糖醇5‑50份海藻糖5‑50份。本发明使用天然食用酸作为护色液代替焦亚硫酸钠在果脯中的护色作用，适量使用抑制相关酶，使用益生元代替蔗糖在果脯中的使用，降低食用的热量，同时使用食用胶体作为填充液均匀渗入果胶，抵消了益生元替代蔗糖后带来对果脯架构的影响；本发明方法制得的去硫减糖益生元果干在味道形态上与添加蔗糖、焦亚硫酸钠的果干无大差异，更加安全营养，具有良好的应用价值。