本发明涉及一种双向密钥池的量子可信中继密钥同步方法及系统，所述方法包括：对量子可信中继节点的密钥池进行读写分离、双向可读初始化处理，得到初始子密钥池；根据所述初始子密钥池的密钥需求量，对所述初始子密钥池进行写入密钥同步；利用量子可信中继节点的初始子密钥池进行量子密钥可信中继的读取密钥同步，提高量子可信中继过程中获取量子密钥或存入量子密钥并行执行效率，降低可信中继过程中密钥损耗，保障了每个量子密钥可信中继节点在量子密钥组网结构中具有对等性。