本发明公开了一种堆叠结构双齿氮配体锌配合物及其制备方法和应用，其化学式为[Zn(L)2SiF6·2H2O]，其中L为1,3‑二咪唑基苯配体。制备方法为：将咪唑、碳酸钾和碘化铜混合并研磨均匀后滴加1,3‑二溴苯，放入烘箱加热反应；结束后处理得到配体L；将Zn(BF4)2/(NH4)2SiF6水溶液滴加于试管底层，再将N,N‑二甲基乙酰胺/乙醇/水混合物加入试管作为缓冲层，最后将配体L的N,N‑二甲基乙酰胺溶液加入试管加盖后室温放置反应，结束后处理得到双齿氮配体锌配合物。本发明制备工艺简单，成本低，条件温和，且为二维层状堆叠结构，层层之间形成的孔道对乙烯分子有显著的筛分效应，能高效的分离乙烯/乙烷。