本发明公开了一种分布式控制系统IO模块硬件地址自适应识别方法及系统，识别方法包括以下步骤：按序排列IO模块底座，并将IO模块底座进行级联连接，每个IO模块底座槽位中插入两个IO模块，使每个IO模块底座对应两个IO硬件地址；通过在IO模块底座和卡件中设计硬件电路实现底座槽位地址的自动排序；在上级IO底座和下级IO底座间通过地址移位的方式实现不同地址的识别。本发明不会受到网络故障或控制器与IO通讯丢失等的影响，能够可靠保证分布式控制系统IO模块硬件地址正确识别。