本发明提供一种橡胶密封圈高精度自动化飞边去除装置及去除方法，该去除装置包括震动盘（1）、装置平台（4）、电机组件（5）和芯棒（9），电机组件（5）设置在装置平台（4）的下部；芯棒（9）设置在电机组件（5）的上方；芯棒（9）为顶部带有锥度的金属棒；芯棒（9）旁设有夹持装置（6）、辅助装置（7）、飞边去除装置（8）和产品收集箱（10）；装置平台（4）上还设有产品传送带（2）和缓冲传送带（3）；所述芯棒（9）远离产品收集箱（10）的一侧还设有抽风装置（11）和吹气装置（12）。该去除方法包括：自动定位、外侧飞边去除、内侧飞边分步去除和自动收集。本发明解决了现有密封圈飞边去除效率低、精度低的技术问题。