本发明公开了一种工程结构健康监测系统服务效能的评价方法及系统，所述方法包括：计算传感器子系统各相互独立单元的服务效能，利用各单元的权重计算传感器子系统的服务效能；计算数据采集和传输子系统的服务效能；计算数据存储与管理子系统的服务效能；计算数据分析与状态评估子系统各单元的服务效能；根据传感器子系统、数据采集与传输子系统、数据存储与管理子系统以及数据分析与状态评估子系统的服务效能及其权重，计算整体服务效能的值；根据整体服务效能的值对工程结构健康监测系统服务效能进行评价。本发明首次提出了工程结构健康监测系统服务能力的评价指标体系，并提供了服务效能的量化计算方法。