本发明涉及食品工程领域，具体涉及一种早产儿配方乳粉及其制备方法。本发明配方乳粉以生牛乳为主要原料，通过添加酪蛋白糖巨肽和低聚糖和其他配料调制而成；以100g配方乳粉计，所述酪蛋白糖巨肽的含量为1～6g，所述低聚糖的含量为2～9g。本发明乳粉配方中添加了酪蛋白糖巨肽，因其富含唾液酸，使早产儿配方乳粉中唾液酸含量远高于目前市场上的早产儿奶粉，可促进婴幼儿智力发育和生长发育。本发明乳粉配方中低聚糖，一方面可促进早产儿肠道微生物健康，另一方面与酪蛋白糖巨肽搭配作用，使早产儿配方乳粉成分接近于母乳，有利于促进婴幼儿的生长发育。