本发明公开了一种预防鸭传染性浆膜炎三价基因工程亚单位疫苗组合物及其制备方法，属于兽用生物制品领域。本发明提供的预防鸭传染性浆膜炎三价基因工程亚单位疫苗组合物包括TbdR1‑T3、SIP‑T3、CAMP、GldG‑T3、OmpA‑T3、TrpB及HA‑T3重组蛋白。本发明的鸭传染性浆膜炎三价基因工程亚单位疫苗，免疫效果良好，免疫剂量小，一次接种就能有效预防鸭疫李默氏杆菌病不同血清型所造成的疾病。本发明的制备方法简单，能大量制备鸭疫李默氏杆菌病的抗原蛋白，耗时短，表达量高，大大降低了生产成本，有利于大规模生产，填补了现有市售鸭传染性浆膜炎疫苗中1型、2型和10型三价疫苗的空白。