本发明涉及一种变电站二次系统中跨区消息同步的实现方法，该方法包括步骤：分别启动变电站安全Ⅰ区和安全Ⅱ区的基础服务；配置待同步消息的消息主题；对所述待同步的消息进行跨区消息同步。变电站二次系统实现了对安全Ⅰ区的主辅一体化监控主机与安全Ⅱ区的综合应用主机的业务数据统一管理和系统基础平台共享，本发明的技术方案通过对变电站二次系统应用跨区消息同步技术，实现了变电站安全分区之间业务数据的统一，并通过在待同步消息中添加同步标签，避免了安全Ⅰ区和安全Ⅱ区之间消息同步的死循环问题。