本发明公开一种带电磁防护功能的输电线路带电作业机器人控制系统，包括集成在PCB板上的控制器、电源模块和通信模块，PCB板上开设有通信接口、模拟输入输出接口和数字输入输出接口，控制器位于PCB板的中央，电源模块、通信接口、模拟输入输出接口和数字输入输出接口分别设置于控制器不同的侧边处，PCB板上不兼容的信号线连接的地线不同；电源模块的各个电压输出端连接有电源滤波器；所述CAN模块具有抗干扰的CAN总线以及无线网桥；所述控制器中设置有软件防护系统，所述软件防护系统用于监测控制系统的硬件状态和通信状态、并对输入的模拟信号进行处理。本发明解决了目前输电线路带电作业机器人抗干扰能力不强的问题。