本发明提供了一种高速公路流量的动态仿真方法和系统，所述方法基于设定的仿真区域，对历史通行大数据进行清洗，得到流量仿真数据集；基于流量仿真数据集，进行车辆成本偏好类型的划分，并根据所划分的类型赋予不同类型车辆以不同的费用和时长权重，将权重赋予每种类型车辆的平均通行费用和平均通行时长，构建综合通行成本模型；基于综合通行成本模型，计算在修改后的路网上不同类型车辆的综合通行成本，构建逻辑路网，从而实现动态流量仿真。本发明基于历史数据结合实际路网动态进行路网修改，再构建逻辑路网，完成路网全局路径推演；依据路径推演结果完成流量动态仿真，从宏观层面反映出整个路网环境的流量变化，为交通管理部门提供了决策依据。