本发明属于网络空间安全防护技术领域，特别涉及一种多功能等价执行体系统的异构度评估方法及装置，该方法包括将拟态系统建模为五元组形式，对功能等价执行体进行组件划分；计算任意两个功能等价执行体之间各个组件的异构度；根据不同类别的网络环境对不同组件类异构度进行权重分配；根据所处的网络环境和各个组件的异构度计算任意两个功能等价执行体之间的异构度；根据功能等价执行体之间的异构度计算出服务集的异构度。本发明利用加权调和平均数避免了局部最大值对整体安全性错误判断问题，再者，对所处的网络环境进行分类，来动态赋予不同组件类异构度不同的权重，提高了系统的动态性。