本发明公开了一种上下交叠隧道施工时既有隧道竖向变形控制结构及施工方法，布设于待新建的新建隧道与最接近的既有隧道之间的上下交叠影响区内，或布设于待新建的新建隧道与其两侧接近的两条既有隧道之间的上下交叠影响区内，包括：沿上下交叠影响区的纵深方向依次间隔设置的刚性隔断层，刚性隔断层包括沿水平方向依次间隔设置且浇筑成型的刚性隔断桩。每层刚性隔断层的刚性隔断桩与既有隧道和新建隧道分别空间呈夹角相交。本发明竖向变形控制结构及施工方法，具有高效、实用的特点，安全、可靠的预防隧道上下交叠区既有运营隧道出现上浮、下沉等竖向变形病害，避免因变形导致的结构应力增加，以及变形处治导致的工期和经济损失。