本发明提供了一种基于频谱熵和随机森林的配电网故障识别方法及系统，其中本发明提供的故障识别方法包括将发生故障后的电气量信息、故障录波信息、系统网络结构作为样本的特征，故障类型作为每个样本的标签，将故障录波信息经频谱熵作用后生成每个样本的能量特征向量也作为样本特征后利用随机森林算法生成若干颗决策树；对每颗决策树选取不同的样本特征进行训练并基于投票制度生成强分类器；将强分类器作为训练好的故障识别网络并对待识别的配电网进行故障识别。本发明频谱熵对故障录波信息进行处理，可以充分利用其中的谐波信息，增强了对于配电网弱数据特征的识别。并且利用随机森林算法可以实现对拥有多个特征的样本进行高准确率的故障识别。