发明涉及扦插式川芎苓种种植机的排种装置及其控制方法，包括两根平行间距设置的输送带，两者的间距处放有川芎苓种，两者将川芎苓种的节盘从两侧夹持抬起；还包括投种箱，其设置在输送带后端处，其呈V型槽状，其槽底具有投放空隙；川芎苓种经投种箱的投放空隙掉落在输送带的间距之间；所述的输送带将川芎苓种从后端移动至前端；还设置有控制系统和导种部件，实现川芎苓种的排列。本发明达到的有益效果是：便于投放种、苓种能自动处于竖直状态、能够实现种排列、自动化程度高。