本发明公开了一种漂流式海水透明度自动测量装置及透明度测量方法，包括支撑架、密封壳、光衰减通道及通信天线，支撑架上方安装供电模块及控制模块，控制模块包括控制器、GPS模块及通信模块，光衰减通道两端分别安装光传感器、光强采集接收模块、LED灯组成检测模块。采用此装置进行透明度分析包括测量准备、光强测量及透明度分析计算，通过光强采集接收模块将光强输送给控制器，通过回归反演分析算法，根据光强度，计算得透明度。本发明测量准确性高；通过使用太阳能供电，随洋流漂流，可对海水透明度进行长期连续的自动监测；通过设紫外灯，可对光衰减通道、LED灯、光传感器进行消杀，避免微生物附着，影响测试结果。