本发明一种顾及换能器瞬时姿态耦合效应的水深改正方法，通过计算不同波束角测深仪换能器的波束脚印的宽度、计算声波传播范围内中心定标点的坐标、确定测线方向上的局部水底地形的坡度、计算波束角和换能器瞬时姿态耦合效应下的波束相对水底的相对侧滚角和相对俯仰角，以确定实际最短回波点与垂直方向的夹角；计算所述实际最短回波点相对所述中心定标点在船体坐标系的位移；该方法针对不同发射角的单波束测深系统具有通用性，易于采用计算机编程实现，不增加计算步骤的复杂性；采用本方法进行数据处理，能显著提升在水下地形的陡坡区域的测量精度和可靠性。