本申请提供一种实现燃煤发电机组碳排放在线监测方法、系统及存储介质，方法包括以下具体步骤：煤场煤种管理及数据分析；配煤掺烧方式确认及入炉煤指标确定；碳排放在线监测：建立碳排放在线监测计算模型，对发电企业燃烧产生的碳排放量及外购电力产生的碳排放分别进行计算；碳排放数据分析及应用管理：建立碳排放数据分析及应用模型，完成机组碳排放强度对标分析、机组减碳措施分析与指导、机组碳资产管理。本申请达到对发电企业碳排放数据的全面、时实感知，并通过建立数据分析模型，进而达到指导发电企业减碳、控碳、碳交易及电网调度部门制定“低碳调度”策略。