本发明公开了在水稻、玉米中高效表达Bt蛋白Cry56Aa1抗草地贪夜蛾的方法，在原有基因Cry56Aa1(GenBank：FJ597621.1)的基础上，将编码蛋白的基因改造为作物偏好的密码子，然后将改造后的基因(水稻：SEQ ID NO.5；玉米：SEQ ID NO.7)导入作物中，本发明中基于Cry56Aa1蛋白本身对草地贪夜蛾的杀虫活性，将其改造后的Cry56Aa1基因在水稻、玉米中高效表达，是转基因作物对草地贪夜蛾具有极强的杀虫活性。在本发明的效果验证试验过程中，也没有发现害虫对该蛋白产生抗性的情况。因此，本发明的Bt蛋白Cry56Aa1具有重要的经济价值和应用前景，适合大规模应用于提高植物的抗虫性中。