本发明公开了一种基于微模块对身份信息进行认证的方法及系统，通过认证终端提交目标对象的身份信息认证请求；通过微模块认证网关接收身份信息认证请求，并读取目标对象的身份证密文信息，将读取的身份证密文信息与预先获取的预约身份密文信息进行身份对比，获取第一身份对比结果；当第一身份对比结果为一致时，向认证终端下发获取目标对象生物识别特征指令；通过认证终端基于目标对象生物识别特征指令获取目标对象的生物特征，并将加密后的目标对象的生物特征密文信息发送，通过微模块认证网关将读取的生物特征密文信息与预先获取的预约生物特征密文信息进行特征对比，获取第二身份对比结果；当第二身份对比结果为一致时，目标对象通过身份认证。