本发明提出一种基于轨道交通ATO系统的停车点计算方法、系统，方法包括：确定停车点分类类型、行车许可位置、信号机保护区段有效性；根据分类停车点有效性、行车许可位置、信号机保护区段有效性计算ATO系统停车点，综合考虑轨道交通不同制式下停车需求，将停车点归为运营(折返线)停车点、参考停车点、障碍停车点和不可追踪停车点四类，根据ATP发送的MA位置和障碍停车点、轨道区段中进站口位置、出站信号机位置、终点站、站台长度等信息，计算得到最合适停车点，降低停车安全风险，满足列车运行要求。