本申请提供了一种针对公钥密码体系的组合侧信道的分析方法及装置，包括：采集密码算法运行过程中产生的能量迹；通过能量分析将能量迹分为多个能量迹片段；从多个能量迹片段中找出最短能量迹片段，并将多个能量迹片段中其他能量迹片段，压缩至与最短能量迹片段长度相等，将压缩后的多个能量迹片段进行分类，根据多个类别的能量迹分别对应的侧信息，确定每类能量迹对应的操作，根据每类能量迹对应的操作，得到多个类别的能量迹的操作序列；根据能量迹的原始变化顺序与多个类别的能量迹的操作序列，得到能量迹对应的密钥信息。本申请将能量信道和时间信道的信息通过先压缩后聚类的方式组合起来，在保证分析效率的同时，提高密钥恢复准确率。