本发明提供一种基于脑机接口的光刺激控制装置及方法，装置包括FPGA控制模块、驱动模块以及Micro‑LED探针阵列模块；所述FPGA控制模块用于根据存储的光学参数基于光遗传学脑机接口算法生成控制指令；所述驱动模块与所述FPGA控制模块的IO端口连接，用于接收所述控制指令生成指定条件的驱动信号；所述Micro‑LED探针阵列模块与所述驱动模块的输出端连接，用于接收所述驱动信号并生成符合指定条件的目标光束；其中，所述符合指定条件的目标光束为：符合指定波长、指定频率、指定形状以及指定强度的光束。本发明能够通过FPGA控制模块使Micro‑LED探针阵列模块产生符合指定波长、频率、强度等条件的光束，光束可用于对神经元进光照刺激，从而实现对神经元的精确刺激。