本发明涉及航电自动测试系统技术领域，具体为一种航电自动测试系统的数据处理系统，包括数据注入装置，通过实时网卡与航电自动测试控制管理设备连接，用于通过模拟驾驶杆及油门杆上按钮触发产生的模拟量及开关量信号，正确给出测试需要的各种信号，辅助实现航电联试的自动化；故障记录处理装置，通过实时网卡与航电自动测试控制管理设备连接，用于记录当前故障发生时间和内容。本发明通过数据注入装置模拟航电自动测试中难以通过机械臂进行操作的油门杆及驾驶杆按钮的各类型信号，实现航电联试自动化；所述故障记录处理装置能够辅助完善航电自动化测试的连续性，并具备故障记录功能，方便技术人员对试验故障进行统一处理，同时能够提高试验效率。