本发明公开一种面向非合作目标的防碰撞悬停轨道控制方法，包括：步骤一，建立基于轨道根数差的相对运动方程与基于高斯摄动的相对运动控制方程；步骤二，任务星通过三次脉冲机动，形成防碰撞构型，实现由远距离到近距离的快速抵近；步骤三，任务星在远距离抵近后进行偏心率误差修正；步骤四，任务星进一步进行半长轴、偏心率调整，为悬停做准备；步骤五，任务星通过三次脉冲机动抵近至指定悬停位置。本发明的方法能够解决现有技术对于非合作目标观测没有考虑防碰撞抵近控制的问题，轨道控制方案简单可靠，易于实现高精度的控制，有效避免了由于轨道测控的延迟和数据传输的不稳定性，导致轨道控制失效的风险。