本发明公开了GNSSRTK测量数据处理技术领域的基于小波分析的定位测量数据粗差剔除系统及方法，包括：获取GNSSRTK测量数据；通过小波基函数和分解层数对GNSSRTK测量数据进行小波变换，得到高频信息和低频信息；基于高频信息确定进行小波阈值处理的高频系数层，在确定的高频系数层使用基于3σ准则的算法进行粗差剔除；将分解后的低频信息和处理后的高频信息进行小波逆变换重组，得到剔除粗差的数据；采用硬阈值法去除剔除粗差后高度方向观测数据中的噪声成分。本发明可以有效准确剔除GNSSRTK测量数据粗差的同时，还能够保留测量数据的有效高频信息。