本发明公开了一种基于棱镜的光源集成型超分辨显微芯片及其成像方法，涉及超分辨显微领域。本发明基于块状高折射基底材料，在其上表面中心设置样品区域，在其下表面设有多圈不同角度的棱镜，将LED分别置于棱镜侧面，再将LED的正负极集成到PCB板上，通过单片机控制LED的开关。相比于外接光路的超分辨显微成像系统，将光源集成到超分辨显微芯片上可实现超分辨成像的小型化和便携性，便于应用于资源紧缺地区的医疗诊断和科研分析。相比于传统的傅里叶叠层显微成像(FPM)，利用棱镜可提高斜入射光源的光强和信噪比以及斜入射范围，引入更大横向波矢的倏逝波，可有效提高成像质量以及分辨率。