本发明公开了一种设置式深水沉井基础及自适应支承转换方法，涉及桥梁施工方法技术领域，一种设置式深水沉井基础，包括井壁，还包括支承转换机构，所述支承转换机构包括柔性灌注模具和注浆组件，所述井壁的底部设有支承部，所述柔性灌注模具固设于支承部的底部，所述注浆组件与柔性灌注模具内部相连通。一种基于所述的设置式深水沉井基础的自适应支承转换方法，包括以下步骤：通过注浆组件向柔性灌注模具内灌注高强灌浆料，灌注有高强灌浆料的柔性灌注模具自适应填充于支承部与基坑岩面间的间隙，待高强灌浆料凝固后设置式深水沉井基础由浮态转换为刚性支承。