本发明提供了一种自适应的全封闭低扰动疏浚绞刀装置、系统及控制方法，绞刀装置，包括绞刀结构、固定罩结构、活动罩结构和泥浆输送系统；绞刀结构包括螺旋式绞刀、转动轴系；螺旋式绞刀在转动轴系的转动下能够切割粉碎淤泥；固定罩结构、活动罩结构沿绞刀结构外侧布置，能够连接外部结构、保护绞刀结构、并形成内部抽吸封闭腔体；泥浆输送系统能够将切割和粉碎的泥浆向上输送。本发明能有效提高挖掘过程中泥浆浓度、提高清淤效率，避免悬浮物扩散和二次污染，解决了环保疏浚难题。同时针对上述装置提出了相应的控制系统和方法，在保证对地压力的同时，实现保护罩对泥面的自适应贴合，保证了清淤过程中挖掘区域的封闭性。