本发明涉及汽车替代燃料技术领域，尤其涉及一种清洁燃料及其制备方法。所述清洁燃料由包括生物柴油基础组分、助溶剂、分散剂、改性剂、甲醇和石化柴油的原料制备得到；所述生物柴油基础组分由棕榈油和甲醇在催化剂的作用下反应得到；所述催化剂包括氢氧化钾和硝酸铈。本发明在制备述生物柴油基础组分的过程中，提高了反应温度，延迟了反应时间，同时采用包括氢氧化钾和硝酸铈为催化剂，因此，在发生酯交换反应的同时发生多种复杂反应，得到产物包含多种含氧极性化合物，促进甲醇在其中分散，形成分散更细，更稳定的乳液。采用上述生物柴油基础组分与其他组分协同作用，可以形成分散粒度小、稳定时间长的清洁燃料。