本发明公开了一种基于组合斜桩的高桩码头上部结构部品化施工方法，包括：桩芯桩帽一体式现浇施工，1)绑扎桩芯钢筋和桩帽钢筋形成部品化钢筋笼；2)安装辅助装置，起吊斜桩桩芯钢筋笼和直桩桩芯钢筋笼并下放至钢管桩内，再装配桩帽钢筋笼形成部品化钢筋笼结构；3)通过辅助装置吊装模板进行支模；4)对桩芯桩帽进行整体浇筑，完成桩芯桩帽的整体现浇施工。还包括5)通过辅助装置，完成节点现浇、预制横纵梁、预制面板的吊装。本发明通过辅助装置，辅助施工高桩码头上部结构现浇桩芯、桩帽、节点和预制横纵梁、面板等构件，将现场作业的混凝土现浇施工和预制构件安装一体化作业，实现整个码头上部结构安全、高效、高质量的部品化施工。