本发明提出了一种无人机综合反制系统及综合反制方法，综合反制系统包括：管理控制分系统、标校分系统、综合感知分系统、综合处置分系统和任务网络分系统，管理控制分系统提供人机交互控制界面，实现综合反制系统工作状态的控制管理；标校分系统用于确定并标校综合反制系统误差；综合感知分系统综合采用多种探测方式感知无人机目标，并持续获取无人机目标信息；综合处置分系统在管理控制分系统指令控制下，基于综合感知分系统获取的无人机目标信息，综合采用多种处置手段对无人机目标进行处置。本发明降低了附加伤害，提升了处置精度，操作方便快捷，具备多通道处置能力，可高效地应对多类型无人机威胁，适用多种无人机反制场合。