本发明公开一种面向进气畸变的进气道/发动机多变量协同控制方法，包括：推导基于线性模型的iLQR算法，在其基础上引入滚动优化仅输出首个控制量；利用该控制律，结合面向进气畸变的进气道/发动机耦合原理，设计进/发多变量闭环控制器，并对系统的性能进行研究。本发明将模型预测控制的思想应用于普通iLQR算法，以进/发状态量与控制量为二次型性能指标，并将进/发共同工作点位置增广进状态量中，对燃油流量、尾喷管临界截面面积、第二级斜板及辅助放气门角度进行控制，设计面向进气畸变的进/发一体化多变量协同控制器，该方法通过依时间迭代计算的方式在线规划解算，形成全局动态优化，解决模型不确定性问题，改善进气畸变造成性能下降。